Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO1Q9P1Z2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms