Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms