Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ARHGEF12Q9NZN5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms