Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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