Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN3Q9NZ94 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN3Q9NZ94 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.1 ms