Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms