Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH8Q9NYR8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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