Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COA4Q9NYJ1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COA4Q9NYJ1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms