Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAH9Q9NYC9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms