Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms