Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDAP2Q9NXN4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms