Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms