Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms