Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms