Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWV8

BABAM1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BABAM1Q9NWV8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BABAM1Q9NWV8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BABAM1Q9NWV8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BABAM1Q9NWV8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms