Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAJC17Q9NVM6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms