Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GINM1Q9NU53 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms