Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms