Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO8Q9NRD0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FBXO8Q9NRD0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms