Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHK2Q9NRA0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms