Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM7Q9NR12 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms