Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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