Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMX1Q9NP08 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms