Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms