Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KIAA1549Q9HCM3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms