Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELL3Q9HB65 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ELL3Q9HB65 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELL3Q9HB65 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELL3Q9HB65 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELL3Q9HB65 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELL3Q9HB65 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELL3Q9HB65 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms