Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms