Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms