Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKRIP1Q9H875 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms