Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms