Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms