Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms