Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms