Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms