Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTMR12Q9C0I1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR12Q9C0I1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms