Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms