Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM6SF1Q9BZW5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms