Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDEM3Q9BZQ6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDEM3Q9BZQ6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms