Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms