Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms