Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPKQ9BS16 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPKQ9BS16 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms