Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms