Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP9Q99956 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms