Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CGREF1Q99674 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CGREF1Q99674 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CGREF1Q99674 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CGREF1Q99674 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGREF1Q99674 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CGREF1Q99674 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CGREF1Q99674 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CGREF1Q99674 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGREF1Q99674 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGREF1Q99674 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGREF1Q99674 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGREF1Q99674 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGREF1Q99674 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGREF1Q99674 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGREF1Q99674 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGREF1Q99674 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms