Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms