Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POP1Q99575 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POP1Q99575 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POP1Q99575 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POP1Q99575 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POP1Q99575 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POP1Q99575 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POP1Q99575 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POP1Q99575 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POP1Q99575 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POP1Q99575 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POP1Q99575 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POP1Q99575 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POP1Q99575 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POP1Q99575 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POP1Q99575 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POP1Q99575 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POP1Q99575 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POP1Q99575 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP1Q99575 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP1Q99575 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP1Q99575 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP1Q99575 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP1Q99575 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP1Q99575 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP1Q99575 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP1Q99575 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP1Q99575 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP1Q99575 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP1Q99575 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP1Q99575 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP1Q99575 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP1Q99575 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP1Q99575 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP1Q99575 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP1Q99575 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP1Q99575 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP1Q99575 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP1Q99575 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP1Q99575 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP1Q99575 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP1Q99575 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP1Q99575 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POP1Q99575 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POP1Q99575 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POP1Q99575 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POP1Q99575 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POP1Q99575 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POP1Q99575 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POP1Q99575 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POP1Q99575 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POP1Q99575 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POP1Q99575 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POP1Q99575 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POP1Q99575 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POP1Q99575 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP1Q99575 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP1Q99575 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP1Q99575 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP1Q99575 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP1Q99575 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP1Q99575 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP1Q99575 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP1Q99575 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP1Q99575 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP1Q99575 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POP1Q99575 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POP1Q99575 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms