Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EYA3Q99504 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms