Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT12Q99456 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms