Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
IFT140Q96RY7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
IFT140Q96RY7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms