Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms